依托太阳成集团tyc122cc建设有农业农村部学科群重点实验室1个（农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室）、中科院1区/广东省高质量发展杂志《Mycosphere》1份、省级工程技术研究中心3个、科技创新中心4个、科技服务平台1个、省级现代农业产业技术研发中心4个。市厅级重点实验室3个：广东省普通高校果蔬病虫害绿色防控重点实验室、广州市特色作物种质资源研究与利用重点实验室和广州市亚热带果树重大疫情控制实验室。

依托学院建设的校级跨学科平台2个：现代种业创新研究院和植物健康创新研究院。

其他校级研究所4个：作物研究所、植物病理学研究所、有害生物入侵预警与控制研究所、生物技术研究所。